组蛋白是核内最丰富的蛋白质,它与DNA构成的复合物称为染色质。染色质最基本的亚单位结构是核小体(nucleosome),它由146个碱基对组成的DNA链缠绕8个组蛋白分子(2个H2A-H2B杂二聚体之间夹着2个杂二聚体H2-H4)2圈构成的核心和核心外的组蛋白H1与连结DNA(约60个碱基对)组成。H1既与核心部分的DNA结合,也与连结DNA结合,后者起连结相邻核小体的作用。5种组蛋白都有各自对应的自身抗体。抗DNA的自身免疫反应与抗组蛋白的自身免疫反应间具有连锁性,抗DNA抗体阳性的患者常同时能检出抗组蛋白抗体,但抗组蛋白抗体阳性并不一定伴有抗DNA抗体。
抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。